Journées nationales de formation en microscopie

A Bordeaux.... Juin 2009
Journées Nationales de Formation en Microscopie / 15, 16 et 17 juin Assises Nationales des plates-formes d’imagerie / Jeudi 18 juin et le "Leica User Meeting" Vendredi 19 juin associé à l'inauguration du microscope STED


	La plate-forme imagerie de Bordeaux a été mise en place avec des partenaires biologistes (IFR de neurosciences), physiciens optique (CPMOH : équipe de nanophotonique), physiciens laseristes (CELIA) et un industriel (Amplitude systèmes). La plate-forme a le label RIO de plate-forme technologique émergente et est donc ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique publique et privée.

	Christel Poujol est ingénieure sur la plate-forme d'imagerie de Bordeaux en tant que responsable technique imagerie et formation. La plate-forme est sous la responsabilité scientifique de Daniel Choquet, la technique microscopie multi-photons, laser, Imaris est assurée par Philippe Legros... et pour l'analyse d'image : Florian Levet ! INB Christel Poujol ces journées pour microscopistes de quoi s’agit il ? Christel Poujol Ces deux évenements , Journées et Assises nationales sont des actions parallèles mais différentes .Les journées nationales de microscopie qui se déroulent sur 3 jours sont organisées par notre réseau national le RT-MFM (Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle) réseau auquel j’appartiens. Pendant ces trois jours nous allons former des scientifiques à des apprentissages particuliers . Quant aux Assises Nationales des plates-formes d’imagerie il s’agit pour une journée, le 18 juin de réunir les microscopistes des plates-formes d’imagerie. Ils viendront de toute la France . Les comités d’organisation ont décidé cette année de coupler ces 2 évenements à Bordeaux . Nous terminerons cette semaine par la "Leica User Meeting" associé à l'inauguration du microscope STED ! INB Comment avez-vous obtenu la tenue de ces journées d’imagerie à Bordeaux ? Christel Poujol J’ai proposé au comité de pilotage national d’organiser cet événement à Bordeaux dans la mesure ou notre plate forme d’imagerie est extrêmement bien équipé , une telle formation en microscopie demande énormément de matériel , notre centre d’imagerie de l’IFR Neurosciences n’a donc pratiquement pas eu besoin d’en faire venir, nous disposons de tous les locaux nécessaires , la logistique s’en est trouvé simplifié ! Mais l’arrivé d’un nouveau microscope : le STED (Stimulated Emission Depletion) un matériel unique en France été déterminante.(nous bénéficions de la premiere installation commercial en France) Quant à la journée des Assises , il s’agit d’une réunion d’une journée réunissant des responsables de plates-formes qui débattrons de problèmes aussi différents que les formats de stockage de fichiers vidéo ou de l’avenir des métiers de plates-formes ! INB Est que le public de ces formations est régional ? Non beaucoup plus large , les éléves microscopistes qui se sont inscrits viennent de toute la France , nous avons du assez rapidement cloturer les inscriptions une fois notre quota d' éléves atteint ! Les formateurs eux aussi viennent de différentes régions ce sont des spécialistes reconnus en différentes techniques de microscopie , comme la microscopie FRAP ou FRET ….			INB Pour les centres de recherche, les plates-formes d’imagerie sont donc devenues incontournables ? Christel Poujol Pour des raisons de coût , toutes les grandes villes françaises sont maintenant équipées de plates-formes d’imagerie. On ne peut plus échapper à la mutualisation des moyens techniques et humains . En ce qui concerne Bordeaux certains IFR s’équipent de microscopes confoncaux mais notre plate-forme de l’IFR 8 neurosciences de Bordeaux développée sur toute la gamme de la microscopie photonique, microscope à épifluorescence, confocal , multiphotonique et la haute résolution avec le STED, est reconnue comme très pointue …. INB Christel Poujol de nouveaux matériels apparaissent régulierement , finalement après quoi court un microscopiste ? Christel Poujol Il faut savoir que nous sommes dans un domaine pluridisciplinaire , nous avons besoin d’informaticiens , de physiciens, de chimistes et de biologistes . Un nouvel arrivant sur notre plate-forme , Jean Baptiste Sibarita se consacre à un nouveau concept qui s’appelle la microscopie PALM (Photo-activation – Localisation – Microscoscopie), une nouvelle technique à haute résolution. C’est essentiellement le but de nos recherches améliorer la résolution de ces matériels. Les évolutions permanentes de la technique permettent aujourd'hui de se pencher sur des processus d'interaction moléculaire (Technique du FRET), ou de dynamique moléculaire (FRAP, FLIP). L’avenir pour nous microscopistes c’est de faire le pont entre la microscopie photonique et la microscopie électronique c’est ce qu’on appelle la microscopie corrélative* ! *La microscopie corrélative optique / électronique permet la visualisation du même évènement en combinant les deux techniques de microscopie. Pour contourner la limitation des différents types de microscopie (résolution différentes , contraintes d’utilisation etc...) il est nécessaire d’étudier les cellules successivement à l’aide de plusieurs types de microscopie puis de combiner les données obtenues. . Cest la microscopie corrélative, elle permet de réaliser une imagerie moléculaire multi-échelle et multi-dimensionnelle recueillis par Yves Deris le 5 juin 2009 pour l'INB

	Résolution de differentes microscopie en nanometre Microscopie optique conventionnel 250 nm Microscopie confocale 150 nm Microscopie STED 90 nm Microscopie PALM 20 nm MET microscopie electronique , peut atteindre 0,8 Ångstroms. 1 Å= 0,1 nm.



	Journées Nationales de Formation en Microscopie Programme Dates : du Lundi 15 Juin au Mercredi 17 Juin 2009 3 jours complets de cours théoriques et travaux pratiques pour 60 personnes Lieu : Bordeaux Plate-forme d’Imagerie Cellulaire de l’Institut de Neurosciences, Institut François Magendie Plate-forme Génomique Fonctionnelle de Bordeaux 146, rue Léo-Saignat, Université de Bordeaux II Public concerné Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Doctorants des instituts publics intéressés par les techniques de microscopie de fluorescence Objectifs Cette rencontre visant au transfert technologique se déroulera sous la forme d’ateliers se composant d’exposés théoriques et d’une mise en pratique autour des microscopes. Les thématiques abordées au cours de ces journées recouvrent une grande partie des domaines d’activités liés à la microscopie du vivant. Ateliers - Microscopie multiphotonique sur échantillon épais et tissus, imagerie par génération de seconde harmonique - Optique pour la biologie : Optique instrumentale fondamentale, à l’usage des biologistes - Mesure de durée de vie de fluorescence pour la mesure d’interactions protéiques dans les cellules vivantes (FRET) - Analyse de la dynamique cellulaire par les techniques de retour de fluorescence après photoblanchiment (FRAP) - Programmation de macro-commandes en vue de l’automatisation de l’analyse d’images. - Principe de la convolution et de l’analyse de Fourier pour le traitement d’images - Métrologie des systèmes : de l’acquisition à l’analyse des tests en métrologie - De la microscopie photonique STED à ultra-haute résolution à la microscopie électronique - Détection de particules et de molécules uniques : de l’acquisition à l’analyse du trafic des récepteurs membranaires Informations Comité d’organisation Anne Cantereau, Poitiers Fabrice Cordelières, Orsay Daniel Choquet, Bordeaux Dominique Dumas, Nancy Laurent Héliot, Lille Philippe Legros, Bordeaux Christel Poujol, Bordeaux